根据总结，通常是由以下两种原因引起的：环境因素主要是以下几种在妊娠早期(孕3个月前)可能引起宝宝唇腭裂的情况：病毒感染，如孕妇上呼吸道感染、风疹等。药物：如服用抗癫痫药、类胆固醇、抗过敏、抗癌药等。内分泌：精神或创伤性因素，如强烈的精神刺激、外部躯体损伤等。营养：孕早期呕吐、厌食、偏食导致维生素D、叶酸、铁、钙的缺乏。其他因素：如X射线照射、吸烟、酒精中毒和缺氧。另外，唇腭裂的病因有相当一部分是遗传的。一般第一胎发生唇腭裂的概率是1/600，如果第一胎是唇腭裂，第二胎发生唇腭裂的概率是3/100。